本課程介紹作物之抗病遺傳原理、已知的相關分子機制、以及由前述知識所衍生的育種策略。內容主要有三個部份: 第一部份由 transmission genetics 的觀點, 解說 Dr. Flor 的 gene-for-gene theory (race-specific resistance), 以及由統計學、流行病學及演化學的觀點解釋 Dr. Vanderplank 的兩個重要學說: horizontal resistance theory (race-nonspecific resistance) 及 stablizing selection hypothesis, 並推衍出 durability 的觀念。第二部份由 molecular genetics 的觀點切入, 介紹 race-specific resistance 、 race-nonspecific resistance、與 innate resistance 的分子基礎。第三部份則配合第一與第二部份的課程內容, 以穿插的方式說明目前已採行的以及未來具有潛力的抗病育種方法，內容包括race-specific resistance 種原的篩選、race-nonspecific resistance的傳統選拔法、 multiline development (MAS 結合傳統育種) 、pyrimiding resistant genes/QTLs、mutagenesis、基因轉殖 (以 RNAi 為主要手段 — 特別針對病毒病害)、以及水稻抗病育種的實務。